La UPGFISI es la Unidad académica encargada de planificar, organizar y dirigir los estudios de Maestrías, Doctorados, Segunda Especialidad y Diplomatura en el ámbito de su competencia en concordancia con el artículo 15 del Estatuto de la UNMSM.

La misión de la Unidad de Postgrado en la Facultad de Ingeniería de Sistemas e Informática es la formación de docentes, profesionales e investigadores con altos conocimientos a nivel científico y tecnológico, de alto sentido ético moral, comprometido con el país, la institución y de liderazgo en Ingeniería de Sistemas e Informática, pero sobre todo íntegros e innovadores que impulsen, mediante un alto nivel de capacitación, la creación de una nueva realidad.